- 院務部（學生一站式服務中心）
- 黨務部
- 發展規劃合作部
- 教務部（ 圖書館、 信息中心、 評估與教學質量監控中心）
- 科技部（重點實驗室、博士后工作站）
- 人力資源部（教師發展中心）
- 學生工作部（ 招生/就業指導中心、 團委、 人武部）
- 后勤保障部（財務部）
- 資產管理部
- 繼續教育學院
- 鄭蒲港校區管理委員會
- 江蘇文天水利規劃設計研究院有限公司
- 南京皖工高新技術研究院有限公司
- 水利工程學院
- 土木工程學院
- 電氣信息工程學院
- 機械工程學院
- 財經學院
- 管理學院
- 藝術設計學院
- 基礎部
- 馬克思主義學院
- 創新創業學院
職能部門
直屬單位
教學院部